Комплектация Flagship включает 18-дюймовые диски, полностью светодиодную оптику, датчики освещения, автоматическую систему управления дальним светом и подсветку зоны выхода при открывании дверей. Появился электропривод багажной двери, атмосферная подсветка салона с палитрой из 42 различных цветов и новые сиденья с развитой боковой поддержкой и обивкой из экокожи с вставками «под карбон». Водительское кресло имеет электрорегулировки по шести направлениям, рулевая колонка регулируется по высоте и вылету. За безопасность отвечают шесть подушек.
Помимо всего перечисленного, Atlas Pro получил электронный стояночный тормоз с функцией удержания, антиблокировочную систему тормозов с распределением тормозных усилий, а также электронного помощника при экстренном замедлении, ассистента при старте и спуске на склоне, систему стабилизации курсовой устойчивости и антипробуксовочную систему.
